Par ailleurs, les Etats-Unis s'opposaient, pour des raisons de sécurité militaire, à ce que les signaux offerts par GALILEO bénéficient d'une modulation qui se superposerait partiellement à celle du futur signal militaire du GPS, dit code M. Les experts européens, ont pu démontrer à leurs collègues américains d'une part l'absence d'interférences préjudiciables entre les signaux émis par GALILEO et par le GPS, d'autre part la parfaite compatibilité technique des deux systèmes, y compris sur le plan des référentiels de temps et de géodésie.
Die Vereinigten Staaten waren auch aus Gründen der militärischen Sicherheit dagegen, dass die von GALILEO ausgesandten Signale sich zum Teil mit dem künftigen militärischen GPS-Signal („M-Code") überlagern. Die europäischen Sachverständigen konnten ihren amerikanischen Kollegen jedoch darlegen, dass zwischen den von GALILEO und GPS ausgesandten Signalen keine störenden Interferenzen auftreten und beide Systeme vollständig kompatibel sind, auch bei den Zeitsignalen und im Bereich der Landvermessung.